باستان‌شناسان با شناسايي سنگ‌نگاري هايي با نقوش تجريدي در كوه‌هاي شمالي شهرستان ندوشن يزد از احتمال وجود انسان ماقبل تاريخ در اين منطقه خبر دادند.
         "ناصر بابايي"، باستان‌شناسان سازمان ميراي فرهنگي و صنايع‌دستي يزد گفت:‌« وجود سنگ نگارهايي با نقوش تجريدي و استريليزه در محدوده کوه هاي شمالي ندوشن و وجود ده ها نقطه که انبوه سرباره‌هاي کوره اي در آنها به چشم مي خورد و چشمه هاي کوچک آب گوارا و شواهدي ديگر مي تواند احتمالي بر حضور انسان در ادوار پيش از تاريخ در منطقه تاريخي فرهنگي ندوشن باشد.»
         همچنين بررسي باستان‌شناسان يزد  به شناسايي 500 اثر تاريخي در شهرستان ندوشن منجر شد که بيش از 80 درصد آن مربوط به دوران پهلوي اول تا ايلخاني است.
       به گفته بابايي چاله هاي شدادي يا سنگ نگارهايي در اطراف معادن قديمي ، حکايت از استخراج و استحصال انواع فلزات در منطقه از کانسارهاي موجود دارد که جهت تعيين قدمت آنها نياز به آزمايش ها و بررسي هاي دقيق باستان شناسي است.
       در بافت تاريخي ندوشن بيش از 500 اثر تاريخي شناسايي شده است .
       مساجد ، اماکن متبرکه چون حسينيه ، امامزاده و آرامگاه مربوط به دوران ايلخاني ، آب انبارها، خانه هاي قديمي، دروازه هاي ورودي شهر، حمام و دربند از جمله آثار باستاني موجود در بافت تاريخي ندوشن است.
      در اين بافت تاريخي 20 برج ديده باني ، اماکن تفريحي ، تاريخي نظير آب نما و خندق و دو کارگاه سنتي آهنگري و يک کارگاه رنگريزي سنتي وجود دارد.
      چهار آسياب آبي که از محورهاي بافت تاريخي ندوشن محسوب مي شود در مسير قنات با دبي ( 60 ليتر در ثانيه) قرار داشته که هم اکنون يکي از آنها در حال فعاليت، يکي محو و بقيه زير خاک مدفون شده است که راه اندازي آن نياز به برنامه کامل پژوهشي دارد.
       حفره هاي توليد زغال سنگ ، فرهنگ عامه مردم و منبر چوبي مسجد جامع با قدمت 547ه. ق ( که از جنس چوب گردو و داراي نقوش تزئيني و کتيبه هايي از آيات قرآن است و در سال 1348 سرلوحه آن توسط افراد ناشناس به آمريکا منتقل شد و هم اکنون در موزه متروپوليتن نگهداري مي شود،) از ديگر جاذبه هاي تاريخي و فرهنگي ندوشن است.
        نسخه هاي قرآن، رساله هاي خطي، کتيبه هاي سنگي، چوبي و گچي در منطقه ندوشن نيز نشاني از سکونت و رونق منطقه در ادوار تاريخي تاکنون است.
         علم و هنر اين منطقه در معماري منارجنبان مسجد جامع ندوشن ديده مي شود و اين منارجنبان به دليل باريکي و سبک ساخت معماري آن توجه هر بيننده اي را به خود جلب مي کند.
        همچنين از ميان صنايع دستي منطقه ندوشن مي توان از توليد شيشه، توليدات فلزي نظير ظروف مسي ، قپان ، تله، قند چين ، گيوه، انواع لباسهاي پشمي، سرمه سازي ، سفال و توليد انواع زين اسب نام برد.
      بافت تاريخي ندوشن به شماره ثبتي 11593 و در تاريخ 24/12/83 در فهرست آثار ملي کشور به ثبت رسيده است.